Добрый день.
Для обсуждения проблем конфигураций сделана специальная ветка форума, и данный топик правильнее поместить там (не исключается ситуация, когда эта ветка туда переедет с помощью модератора).
На счет непонятности - не могли бы Вы привести пример, т.е. расписать подробно, какое количество товара было оприходовано, какими документами, по каким приходным и розничным ценам. Какое количество товара было продано, какими документами, по каким ценам, былал ли скидка. В таком случае разобраться в ситуации будет быстрее и проще. Описание ситуации лучше написать по почте:
makarovda@shtrih-m.ru и
ark@shtrih-m.ru.